В утвержденном Примерном положении сказано, что определение размеров заработной платы осуществляется в соответствии с системой оплаты труда работников учреждений, как по основным должностям, так и по должностям, занимаемым в порядке совместительства. Оплата труда работников учреждений, занятых по совместительству, а также на условиях неполного рабочего дня или неполной рабочей недели, производится пропорционально отработанному времени либо в зависимости от выполненного объема работ. Определение размеров заработной платы по основной должности, а также по должности, занимаемой в порядке совместительства, производится раздельно по каждой из должностей.

Фонд оплаты труда работников учреждения формируется исходя из объемов бюджетных ассигнований на обеспечение выполнения функций учреждения и соответствующих лимитов бюджетных обязательств в части оплаты труда работников учреждения.

Положением определена система оплаты труда работников учреждения, которая устанавливается с учетом:

• единого тарифно-квалификационного справочника работ и профессий рабочих;
• единого квалификационного справочника должностей руководителей, специалистов и служащих или профессиональных стандартов;
• государственных гарантий по оплате труда;
• перечня видов выплат компенсационного характера в федеральных казенных учреждениях;
• перечня видов выплат стимулирующего характера в федеральных казенных учреждениях;
• настоящего Положения;
• рекомендаций Российской трехсторонней комиссии по регулированию социально-трудовых отношений по установлению на федеральном, региональном и местном уровнях систем оплаты труда работников государственных и муниципальных учреждений;
• мнения представительного органа работников;
• систем нормирования труда, определяемых работодателем с учетом мнения представительного органа работников или устанавливаемых коллективным договором на основе типовых норм труда для однородных работ (межотраслевых, отраслевых и иных норм труда, включая нормы времени, нормы выработки, нормативы численности, рекомендуемые штатные нормативы, нормы обслуживания и другие типовые нормы).

Также в Положении определено, что в  районах с особыми климатическими условиями к заработной плате работников учреждений применяются:

• районные коэффициенты;
• коэффициенты за работу в пустынных и безводных местностях;
• коэффициенты за работу в высокогорных районах;
• процентные надбавки за стаж работы в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, в южных районах Восточной Сибири и Дальнего Востока.

Минимальный размер доплаты за работу в ночное время (с 22 часов до 6 часов) составляет 20% оклада (должностного оклада), рассчитанного за час работы, за каждый час работы в ночное время.

Работникам учреждения устанавливаются следующие виды выплат стимулирующего характера:

• выплаты за интенсивность и высокие результаты работы;
• выплаты за качество выполняемых работ;
• выплаты за стаж непрерывной работы, выслугу лет;
• премиальные выплаты по итогам работы.

Выплаты за стаж непрерывной работы, выслугу лет устанавливается всем работникам учреждений в зависимости от общего стажа трудовой деятельности по специальности, необходимой для выполнения должностных обязанностей работника. Ежемесячный размер выплат за стаж непрерывной работы, выслугу лет составляет (в процентном отношении к должностному окладу):

• стаж работы от 1 года до 3 лет - 10%;
• стаж работы от 3 года до 5 лет - 15%;
• стаж работы от 5 года до 10 лет - 20%;
• стаж работы от 10 года до 15 лет - 25%;
• стаж работы свыше 15 лет - 30%.

Положением установлены показателями эффективности учреждений для определения конкретного размера премирования руководителя по результатам работы учреждения за определенный период.

В Приложении к Положению размещены размеры окладов по профессиональным квалификационным группам / квалификационным уровням.